生物信息學/R語言在生物信息學的應用
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生信分析相關的R包 編輯
reshape：長短數據轉換 編輯
reshape：http://had.co.nz/reshape/
https://cran.r-project.org/web/packages/reshape2/index.html
ggvis可視化：https://ggvis.rstudio.com/
shiny類 編輯
shiny的UI進階設計：https://unleash-shiny.rinterface.com/
shiny和SQL數據庫：https://bookdown.org/msharkey3434/ShinyDB_Book/
R, plotly, shinyR, plotly和shiny：https://plotly-r.com/
相關書籍/資料 編輯
數據分析殘卷：https://bookdown.org/yufree/datadown/
bookdown：https://bookdown.org/
http://cran.r-project.org/doc/contrib/Short-refcard.pdf
RStudio Cheatsheets：https://www.rstudio.com/resources/cheatsheets/
R函數在線參考文檔：https://rdrr.io/
- Statistical tools for high-throughput data analysis：http://www.sthda.com/english/
- R語言與統計生物信息學：
- R Bioinformatics Cookbook，使用 R 和 Bioconductor 執行 RNAseq、基因組學、數據可視化和生物信息學分析：https://www.packtpub.com/product/r-bioinformatics-cookbook/9781789950694
免費視頻課程 編輯
Bioconductor 編輯
- Bioconductor課程：http://www.bioconductor.org/help/course-materials/
- 斯坦福的Bioconductor課程：https://web.stanford.edu/class/bios221/about.html
- Biostars的R專題：https://www.biostars.org/t/R/
- R編程：https://www.youtube.com/c/RProgrammingDDS
- 【生信技能樹】生信人應該這樣學R語言：https://www.bilibili.com/video/av25643438
- 【生信技能樹】公共數據庫挖掘實例（基於R語言）：https://www.bilibili.com/video/av37568990
- R語言入門生信應用基礎課程：https://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1209044861
- R語言入門數據分析：https://ke.qq.com/course/366588
- 生物信息學入門基礎講座的R部分：https://ke.qq.com/course/270841
- PlottinginRforBiologists：https://marianattestad.com/blog