生物信息學/Cicero

Cicero：scATACseq分析（結合Monocle）

Cicero相關連結

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• Cicero教程
• Cicero參考文獻
• Cicero引用

Cicero的安裝

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(c("Gviz", "GenomicRanges", "rtracklayer"))
install.packages("devtools")
devtools::install_github("cole-trapnell-lab/cicero-release", ref = "monocle3")

Cicero的功能

• 構建cis調控網絡
• 單細胞染色體發育軌跡