儀器構造 编辑
儀器外貌
利用等張溶液，讓含有螢光標記的液體樣本越來越狹窄，直到寬度只有一個細胞大小，然後利用雷射激發檢品中的螢光物質，使其散發螢光並由感應器偵測螢光強度，或是偵測發散光的折射角度
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在細胞週期分析的應用 编辑
圖下為應用於（正常細胞之）細胞週期實驗的數據
橫軸為螢光強度，縱軸為細胞數量，最高峰（左邊往右邊數的第一個波鋒）代表細胞在G1，此時的染色體數量為2n；下一個明顯的波鋒則代表細胞在G2和M期，此二期的染色體數量皆為4n；介在這兩明顯波峰之間代表著S期，染色體正在複製，因此染色體數量從2n到4n都有。由於細胞週期中，有約46%的時間在G1（為細胞週期四個階段中所站時間最長的時期），因此第一個波鋒的高度最高，因為大部分的細胞落在此時期